Президиум Ассоциации коренных малочисленных народов Севера, Сибири и Дальнего Востока РФ является исполнительным органом и осуществляет оперативное руководство Ассоциации в период между заседаниями Координационного Совета по реализации решений Съезда и Координационного Совета.

Президиум осуществляет текущее и перспективное планирование деятельности Ассоциации; организует и развивает сотрудничество и связи Ассоциации с другими государственными, общественными, и иными организациями; рассматривает вопросы подготовки к плановым мероприятиям Ассоциации; рассматривает предложения по награждениям почетными грамотами активистов Ассоциации; осуществляет контроль за выполнением плановых мероприятий Ассоциации.

Решения Президиума принимаются простым большинством голосов членов Президиума, при наличии кворума. Заседания Президиума созываются Президентом Ассоциации.

• 

  Новьюхов Александр Вячеславович Президент Ассоциации коренных малочисленных народов Севера, Сибири Дальнего Востока Российской Федерации
• 

  Гаюльский Артур Иванович Первый вице-президент Ассоциации. Координация работы региональных общественных организаций и членов Ассоциации в Сибирском федеральном округе
• 

  Алферова Людмила Александровна Вице-президент Ассоциации по вопросам культуры, образования и науки. Координация вопросов, связанных с образованием КМН, культурными и просветительскими проектами, научной и исследовательской деятельностью
• 

  Вэнго Валерий Хольмович Вице-президент Ассоциации по вопросам развития традиционной хозяйственной деятельности КМН
• 

  Латышева Наталья Федоровна Вице-президент Ассоциации по Северо-Западному федеральному округу
• 

  Лиманзо Алексей Геннадьевич Вице-президент Ассоциации по социальным вопросам и правозащитной деятельности. Координация работы по обеспечению специальных индивидуальных прав КМН, включая участников СВО
• 

  Отке Анна Ивановна Вице-президент Ассоциации по Дальневосточному федеральному округу и международной деятельности
• 

  Яунгад Эдуард Хабэчевич Вице-президент Ассоциации по Уральскому федеральному округу и по вопросам Арктики, кочевым и полукочевым народам